福建geochip测试服务(FJNU-JJ-220076)采购公告

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打印公告 geochip测试服务(FJNU-JJ-******)采购公告 发布时间:****-**-** **:**:**阅读量:**次 项目名称 geochip测试服务 项目编号 FJNU-JJ-****** 公告开始日期 ****-**-** **:**:** 公告截止日期 ****-**-** **:**:** 采购单位 福建师范大学 付款方式 服务完成、验收合格付清全款 联系人 中标后在我参与的项目中查看 联系电话 中标后在我参与的项目中查看 签约时间要求 成交后*日内 到货时间要求 签约后**个工作日内 预算总价 ¥ ******.** + NaN + NaN 发票要求 增值税普通发票 增值税专用发票 含税要求 送货要求 安装要求 收货地址 福建师范大学地理科学学院 供应商资质要求 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 公告说明 采购清单* 采购商品 采购数量 计量单位 所属分类 GeoChip服务 ** 个 软件开发服务 无 无 品牌 品牌* GeoChip 型号 **K 品牌* 型号 品牌* 型号 预算单价 ¥****.** 技术参数及配置要求 *.森林土壤样品 GeoChip检测:*.* 完成**个土壤样本的DNA提取。DNA样本质检结果要求:无 RNA、蛋白质等杂质污染,OD***/***:***.******.***,D***/***:***.******.***;DNA浓度≥**ng/ul,总量≥*ug。如个别样本不能满足后续实验需求,免费重新抽提质检;*.* 基于荧光标记和芯片杂交的GeoChip技术,检测**个土壤样本的GeoChip **K功能基因的信号和丰度信息。GeoChip **K检测数据质量要求:***.******.***必须使用 Multi-TIFF模式对芯片进行扫描,生成图片格式数据;***.******.*** 必须使用Agilent Feature Extraction 软件将探针的光学信号转换为数字信号;***.******.*** 必须使各个样本光强总和调整到同一批次光强最高的样本的水平;***.******.***每个点周围的空白点的信号强度用于计算信噪比,移除信噪比小于 *.* 的信号点;*. 森林土壤样本的GeoChip数据分析:*.*功能基因组成分析基于raw_data分别统计各样品在功能大类、功能亚类和基因层级的探针检出数及信号强度,同时绘制柱状图和热图,并基于raw_data中探针的有无进行样品间/组间共有特有探针数统计以及 venn 图的绘制。*.* Alpha 多样性分析基于normalized_data进行Alpha多样性指数计算,了解各样品探针的多样性,同时以柱状图的形式进行展示。*.* Beta多样性分析基于normalized_data进行Beta多样性指数计算,得到样品间距离矩阵,了解样品间探针 构成的差异性和相似性,并结合样本距离heatmap图进行直观展示。*.*降维分析基于normalized_data或Beta多样性指数的距离矩阵进行PCA、PCoA和DCA等降维分析,以便直观展示样本间的差异性和相似性。*.*组间差异分析基于normalized_data分析组间功能结构的差异是否显著,默认选择常见的Anosim和Adonis等组间群落差异显著性检验方法.基于norm_gene_intensity、norm_sub_cat_intensity、 norm_gene_cat_intensity分析gene、sub_cat及gene_cat层级对应的探针信号强度在组间的差异大小,挖掘组间有显著差异的基因或功能类别。*.* 相关性分析基于normalized data进行基因和环境参数的基础相关性分析,并以heatmap图进行展示,并进一步进行CCA/RDA分析,BioEnv分析,VPA分析,曼特尔检验等。*. 其它要求:*.* 所获得的数据成果所有权归采购人所有;*.* 中标人需与采购人充分沟通样品制备、保存及运输方式以使项目顺利进行。*.*获得GeoChip产品厂家Glomics Inc.的代理授权证明。 参考链接 售后服务 服务年限:质保期一年; ****-**-** **:**:** 竞价招标详情请到:https://***.******.***/publish/****/**/**/**L*W*URA***O**M.shtml
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