江苏泰州泰州丰达农牧科技有限公司 - 竞价公告 (CBFDNM2023000001)-泰州鹅分子身份证构建
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首页 采购需求 竞价需求 ****** - 竞价公告 (CBFDNM**********) 发布时间:****-**-** **:**:** 截止时间:****-**-** **:**:** 基本信息: 申购主题:泰州鹅分子身份证构建 报价要求:国产含税 发票类型:增值税普通发票 付款方式:合同签订后付款 送货时间:合同签订后*天内送达 安装要求:免费上门安装(含材料费) 预算:****** (元)我要报价 收货地址:江苏省/**** 备注说明: 申购明细: 序号 *采购内容 泰州鹅分子身份证构建数量 *批预算单价 品牌无型号无规格参数*)全基因组重测序:对***个动物样本进行基因组重测序。 a.要求每个个体测序深度为**×,每个样品产生不低于**.*G数据; b. 测序得到的reads质量Q(-**log**(P),其中P为Phred质量评分)应大于**;Q(该reads所有碱基质量值的平均值)大于**的部分应占总reads质量**%以上;c.所有的reads的长度应一致,不一致长度的reads占总体reads的占比最大不得超过**%;d.reads中如果含有接头则需要修剪接头,同时对低质量碱基部分也进行修剪,在修剪完成后,reads的长度仍保留其原有长度的**%以上,该reads予以保留;
e.样品测序数据中GC含量应在**%-**%范围内;f.测序结果中重复序列reads占比不得超过**%,**次以上重复的序列在所有reads中占比不得超过**%。
*)变异检测分析:根据测序数据,对每个样本进行基因组变异信息(SNP、InDel)分析。
*)品种特异位点基因挖掘:根据个体基因型数据及表型信息,进行品种特异性位点基因挖掘。结合样本品种信息和基因型数据,进行生物信息学分析,挖掘性状关联位点,测试并优化位点集。
*)品种鉴定芯片设计:基于基因组变异信息和功能位点,筛选和优化位点集,设计**K密度品种鉴定芯片。 a.位点数目:不少于*万个SNP位点;b.测序深度:SNP位点平均测序深度≥***X;c.数据质量:位点检出率>**%(≥*X)、样本检出率>**%。
*)品种鉴定分析:基于芯片数据,搭建品种纯种参考库,对***个待测样本进行品种鉴定分析。对待测样本进行芯片检测、数据质控和血统含量分析(包括数据和可视化结果)。
*)售后由专门技术对接,对后期分析作图提供专业化指导和协助。质保及售后服务服务年限:*年;附件竞价中国建设招标网址请到:https://***.******.***/#/purchase/detail/*b*cc*bd********b*faa****eb**ef*(请复制到浏览器地址栏粘贴)