中山大学附属第五医院高通量测序项目市场调研会公告（第二次）[****]采购耗材***号发布时间：****-**-** 点击率：各（潜在）供应商: 为充分了解市场情况，我院对高通量测序项目召开市场调研会。欢迎符合相应资格条件的供应商来我院进行产品宣介。 一、采购项目编号：[****]采购耗材***号 二、采购项目名称：中山大学附属第五医院高通量测序项目市场调研会 三、项目资金来源：医院自筹 四、项目需求清单 项目*：耗材采购项目序号产品名称功能/配置需求*泛实体瘤实体瘤组织DNA联合RNA高通量基因检测及微卫星状态MSI、肿瘤突变负荷TMB检测：DNA基因数≥***、RNA基因数≥***（*）检测内容： ***+个DNA、***+个RNA，用于全面覆盖靶向治疗、免疫治疗、放化疗、遗传风险、表观/上下游/预后等肿瘤相关基因，以及TMB、MSI、HLA、HED等免疫标志物检测（适用于肺癌、 卵巢癌、 乳腺癌、 胃肠道肿瘤、前列腺癌、 甲状腺癌、 肾癌、 胰腺癌、尿路上皮癌、 膀胱癌、中枢神经系统以及软组织肿瘤等瘤种）。（*）检测方法：可逆末端终止测序法。（*）应用情况：本产品相关合作项目已完成临床入组，且入组数量不低于***例。（*）分析技术：拥有独家融合专利算法，可确保融合最大化检出。（*）平均测序深度：组织有效测序深度≥***×，对照血液测序深度≥***×。（*） Panel Size：DNA≥*.*M，RNA≥*.*M。（*）检测突变类型及检出限：SNV：*%；CNV：*拷贝；Fusion；Indel：*%。（*）探针覆盖：覆盖全部基因的外显子（必须提供NTRK IGV可视化图和bam文件进一步确认,验证提供探针覆盖NTRK *个基因的全部CDS区，以及融合断点常见intron区和已知的文献报道过热点突变的重要内含子区域。*泛实体瘤治疗靶点检测：≤**基因数≤**基因（*）检测试剂盒检测范围至少包含EGFR、KRAS、MET、ERBB*、BRAF、PIK*CA、ALK、ROS*、RET、CD***、TP**、CDKN*A、CDKN*B、FGFR*、FGFR*、FGFR*、STK**及NTRK。探针可涵盖所有基因的全部外显子及重要基因的部分内含子，并提供相关证明材料（必须提供NTRKIGV可视化图和bam文件进一步确认,验证提供探针覆盖NTRK *个基因的全部CDS区，以及融合断点常见intron区；可检测的突变类型包括单碱基点突变、DNA小片段和大片段的插入和缺失、基因拷贝数扩增和丢失、基因融合/重排等变异类型，为肺癌患者提供靶向用药指导。（*）支持检测样本类型：FFPE、新鲜组织、胸腹水、脑脊液、心包积液等。（*）测序质量： Q**≥**%。（*）可检测MET基因的所有突变类型（如缺失和基因扩增，以及MET-**skip等）。（*）可检测ALK基因所有融合伴侣基因（包括但不限于EML*，KIF*B、STRN等），以及基因间区融合等所有突变亚型。（*）可检测 ROS*基因所有融合伴侣基因（包括但不限于 CD**，SLC**A*，CCDC* 和GOPC(FIG)等）及所有突变亚型。（*）可检测RET基因所有融合伴侣基因（包括但不限于 KIF*B，NCOA*和CCDC*等）及所有突变亚型。（*）对于低核酸投入量（≤**ng）及较长年限（≥*年）的样本也能兼容，满足穿刺小样本检测需求均可用于本试剂盒检测的优先。（**）探针杂交模式为每个样本单独杂交的优先，确保每个样本杂交充分（尤其是低质量样品），提高低质量样品的兼容性。（**）有效测序深度≥***X。（**）基于可逆末端终止测序法，采用液相探针杂交捕获法建库方式。*泛实体瘤治疗靶点及微卫星状态MSI检测：*** ≤基因数≤***（*）主要适用寻求靶向治疗机会、实现精准个体化治疗及通过动态监控进行精准全程管理的各类肿瘤患者(包括肺癌、卵巢癌、乳腺癌、胃肠道肿瘤、前列腺癌、甲状腺癌、肾癌、胰腺癌等)。探针可涵盖所有基因的全部外显子及重要基因的部分内含子，并提供相关证明材料；可检测的突变类型包括单碱基点突变、DNA小片段和大片段的插入和缺失、基因拷贝数扩增和丢失、基因融合/重排等变异类型，以及微卫星不稳定性（MSI）分析结果等信息；（*）至少平行检测CD***、POLE、POLD*、JAK*/*、EGFR、ALK、 CDKN*A、CDKN*B、FGFR*、FGFR*、FGFR*、STK**等免疫疗效预测生物标志物；（*）可检测DDR，涵盖主要的HRR，MMR等DNA损失修复相关基因≥**个，涵盖遗传易感基因≥**个，涵盖商品化靶向药物和I到III期在研药物靶点基因；（*）可检测微卫星不稳定（MSI）状态，包含的基因的全外显子及部分内含子，与传统金标准检测方法(PCR法)相比达**%以上的一致性；（*）对于低核酸投入量（≤**ng）及较长年限（≥*年）的样本也能兼容，满足穿刺小样本检测需求；（*）支持检测样本类型：FFPE、新鲜组织、胸腹水、脑脊液、心包积液等。（*）有效测序深度≥***X；（*）基于可逆末端终止测序法，采用杂交捕获法建库建库方式；（*）检测区域大小：***K；*泛实体瘤治疗靶点及微卫星状态MSI、肿瘤突变负荷TMB检测：基因数≥***（*）基因突变检测：探针可涵盖所有基因的全部外显子及重要基因的部分内含子，并提供相关证明材料；检测的突变类型包括单碱基点突变、DNA小片段和大片段的插入和缺失、基因拷贝数扩增和丢失、基因融合/重排等变异类型、基因组微卫星不稳定（MSI）和肿瘤突变负荷（TMB）等，用于全面覆盖靶向用药指导、免疫治疗疗效预测和遗传易感风险评估（适用于肺癌、 卵巢癌、 乳腺癌、 胃肠道肿瘤、前列腺癌、 甲状腺癌、 肾癌、 胰腺癌、尿路上皮癌、 膀胱癌、中枢神经系统以及软组织肿瘤等瘤种）。（*）可用于同源重组修复缺陷（HRD）基因检测，并可评估基因组中杂合性缺失（LOH），提供相应一致性比对数据。（*）可检测微卫星不稳定（MSI）状态，包含的基因的全外显子及部分内含子，评估位点≥***个，与传统金标准检测方法相比达**%以上的一致性。（*）对于低核酸投入量（≤**ng）及较长年限（≥*年）的样本也能兼容，满足穿刺小样本检测需求。（*）有效测序深度≥***X。（*）支持检测样本类型：FFPE、新鲜组织、胸腹水、脑脊液、心包积液等。（*）panel覆盖范围≥*.*M。（*）基于可逆末端终止测序法，采用杂交捕获法建库建库方式。（*）产品性能相关：具备基因二代测序相关临床验证性文章，并提供panel性能验证报告。*生殖系统肿瘤HRD靶点检测（*）检测SNP位点数不低于*****个。（*）针对HRR重点基因的NGS检测试剂盒，同时获得HRR基因胚系与体系突变状态的信息。用于检测BRCA*/BRCA*在内的**-**个同源重组修复相关基因的点突变、插入、缺失等多种变异类型。（*）可覆盖与DNA同源重组修复、错配修复等通路以及实体瘤精准诊疗密切相关的基因，涵盖商品化靶向药物和I到III期在研药物靶点基因（*）健全的胚系变异解读策略。（*）样本要求：石蜡组织样本，新鲜组织。（*）对于低核酸投入量（≤**ng）及较长年限（≥*年）的样本也能兼容，满足穿刺小样本检测需求。（*）能检测BRCA*/*大片段重排的优先。（*）参与了注册临床试验的优先。（*）基于可逆末端终止测序法，采用杂交捕获法建库建库方式，灵敏度*%，有效测序深度≥***X 。*淋巴瘤分子分型、预后预测及治疗靶点检测（*）检测包括DNA测序：包含与淋巴瘤发生机理及靶向治疗密切相关的基因，利用探针杂交法富集基因的全部外显子区域和部分基因的内含子区域，并提供相关证明材料；精准检测其中与淋巴瘤有明确临床相关性的基因突变、拷贝数变异及重排（融合）等变异；基于权威TCGA数据库，NCCN指南及**** WHO共识，全面覆盖常见淋巴瘤诊断分型相关热点突变(单碱基突变/插入/缺失/融合/拷贝数变异)。（*）能检测MYC、BCL*、BCL*、CD**、ALK等基因重排。（*）检测结果可辅助临床精准分型，提示预后状态，辅助临床治疗方案的选择，充分体现淋巴瘤诊疗、预后、诊断信息。（*）样本要求：石蜡组织标本。（*）对于低核酸投入量（≤**ng）及较长年限（≥*年）的样本也能兼容，满足穿刺小样本检测需求。（*）有效测序深度≥***X 。（*）基于可逆末端终止测序法，采用杂交捕获法建库建库方式， *甲状腺良恶性判断靶点检测（*）针对甲状腺癌中常见突变或融合基因设计，至少包含NTRKI、PPARG、ALK、BRAF、NRAS、TERT，可用于甲状腺结节的良恶性判断、分子分型与预后预测；针对良恶性判断、分子分型、预后预测，兼顾甲状腺癌髓样癌遗传易感性（RET突变）。（*）样本要求：石蜡组织标本，新鲜组织。（*）对于低核酸投入量（≤**ng）及较长年限（≥*年）的样本也能兼容，满足穿刺小样本检测需求。（*）有效测序深度≥***X 。（*）基于可逆末端终止测序法，采用杂交捕获法建库方式。*子宫内膜癌分子分型检测适用于子宫内膜癌患者的肿瘤组织检测，为分子分型、靶向治疗用药指导、免疫治疗用药指导及肿瘤家族遗传易感性评估提供依据。（*）覆盖与子宫内膜癌治疗和预后相关基因，包含子宫内膜癌的分子分型相关基因及指标，如TP**、POLE、MSI，输出分子分型模块，辅助患者预后判断，辅助临床分层治疗。（*）包含MLH*、MSH*、MSH*、PMS*、EPCAM等遗传性子宫内膜癌相关基因。（*）可检测微卫星不稳定（MSI）状态，包含的评估位点≥***个，与传统金标准检测方法相比达**%以上的一致性。（*）包含药物代谢与毒性相关的重要基因SNP。（*）样本要求：石蜡组织标本，新鲜组织。（*）对于低核酸投入量（≤**ng）及较长年限（≥*年）的样本也能兼容，满足穿刺小样本检测需求。*遗传易感相关基因的血液检测（*）用于检测与实体肿瘤遗传易感性密切相关的基因，可在DNA水平上一次性检出基因的不同变异类型，包括点突变、插入缺失、拷贝数变异等 ，并支持胚系和体系检测。（*）覆盖各国际、国内指南中明确指出的常见遗传易感性基因，至少包括以下：APC，ATM，BARD*，BMPR*A，BRCA*，BRCA*，BRIP*，CDH*，CDK*，CDKN*A，CHEK*，EPCAM，FH，GREM*，HOXB**，MAX，MEN*，MLH*，MSH*，MSH*，MUTYH，NBN，PALB*，PALLD，PMS*，PTEN，RAD**C，RAD**D，RB*，RET，SDHA，SDHAF*，SDHB，SDHC，SDHD，SMAD*，STK**。（*）探针可涵盖所有基因的全部外显子及重要基因的部分内含子。项目*：设备租赁项目（设备清单如下，但不限于）拟放置区域设备名称、数量组织准备区切片机**样本制备区破碎仪**单道可调式移液器（各不同量程**）八道移液器**台式高速离心机**恒温混匀仪**超声打断仪**漩涡振荡器**掌式离心机**紫外消毒车**干式恒温器**全自动提取仪**文库制备区磁力架**PCR扩增仪**漩涡振荡器**掌式离心机**紫外消毒车**迷你板式离心机**掌式离心机**医用冷藏冷冻箱**冰箱温度计**单道可调式移液器（各不同量程**）八道移液器**杂交捕获区八道移液器**基因扩增仪**迷你板式离心机**生物大分子分析仪**荧光定量仪**单道可调式移液器（各不同量程**）PCR扩增仪**真空离心浓缩仪**医用冷藏冷冻箱**干式恒温器**垂直混匀仪**微孔板离心机**漩涡振荡器**紫外消毒车**掌式离心机**磁力架**电泳区微波炉**分析天平**通用型电泳仪**电泳槽**凝胶成像系统**单道可调式移液器**医用冷藏箱**紫外消毒车**测序区基因测序仪**医用冷藏箱**USP**项目*：服务项目服务项目*、能够提供*对*生信技术服务；提供*对*医学团队；提供专业的基因检测结果解读和咨询。*、人员培训（方案和需要达到的水平如下）（*）方案***.******.***、需提供湿实验培训人员一名，干实验培训人员三名，质量体系培训人员一名，五名人员需驻点*-*个月完成相关培训内容；***.******.***、培训课程需满足至少**节课程，课程内容包含实验操作、实验理论、数据分析、异常数据处理、质量培训、产品培训等；***.******.***、需培训至少*名可独立完成生信注释的人员，至少*名可独立完成湿实验的人员；***.******.***、协助建立完整的质量体系（按照ISO*****要求）***.******.***、每年根据院方实际情况增加对应的进阶培训。（*）培训效果***.******.***:被培训人员熟练掌握干湿实验的操作方法，并了解相关原理，颁发考核通过证明材料。***.******.***：被培训干实验人员需熟练掌握Java、Python、R语言等，并颁发考核通过证明材料；***.******.***：被培训人员需熟练操作Linux系统，并颁发考核通过证明材料；备注：各潜在供应商需响应全部项目参加四、服务期：合同期内 五、服务地点：中山大学附属第五医院 六、报名方式及要求：采用邮件报名方式或现场报名方式。符合资格条件的供应商请将以下资料打包扫描发送至邮箱zdwyfyk@***.com进行报名： *、厂家有效的营业执照复印件及生产许可证、产品注册证等相关证件 (加盖公章)； *、供应商有效的营业执照复印件及医疗器械经营许可证相关证件 (加盖公章)； *、法定代表人/负责人资格证明书、法定代表人/负责人授权委托书(加盖公章)； *、授权书(加盖公章)； *、报价单（项目报价包括核酸提取试剂盒至测序过程所需的耗材）（详见附件）(加盖公章) ； *******资质及合作协议等证明材料复印件(加盖公章)； *、需提供检测报告模板证明材料。(加盖公章)（检测报告质控信息至少包含：DNA 总量(ng)，DNA 片段降解程度，预文库总量(ng)，文库总量（ng），文库片段评估（bp），平均测序深度， 文库多样性，插入片段长度(bp)，覆盖均一性，序列回贴比率，碱基质量Q** 占比，配对样本纯合子一致性）； *、提供*家以上三甲医院运营支持成功案例。(加盖公章)（提出针对本项目的服务方案，应包括但不限于服务团队人员、分析软件、报告周期、自动化程度、运营支持方案等方面）； *、用户名单(加盖公章) （清单中所列明的客户，均需是高通量肿瘤突变基因检测项目（包括检测服务或试剂盒销售），提供与该客户的成交依据，如：合同、发票、中标通知书等。若客户清单或成交依据中存在虚假信息，将导致投标无效并将被记入我院供应商不良信用档案）； **、质量承诺函（详见附件）(加盖公章)； **、厂家实验室获得省卫健委临检中心颁发的基因扩增实验室证书复印件，实验室通过 ISO*****等质量体系认证，需提供证书复印件证明（证书中包含基于高通量二代测序技术组织检测项目和/或ctDNA检测项目）；提供国家卫健委临床检验中心****年度全国实体瘤体细胞突变高通量测序检测、全国实体瘤体细胞突变高通量测序检测生物信息学分析、全国肿瘤游离DNA基因突变高通量测序检测室间质评合格证书复印件(加盖公章)（有则提供）；七、报名截止时间：****年*月**日中午**:**，逾期或未按照要求填报资料，视为无效报名。 八、调研会时间：****年*月**日下午**:**。 九、调研会地点：珠海市香洲区梅华东路**号中山大学附属第五医院分子影像中心旁*A号后勤楼***会议室 十、本次调研会在上述规定的时间和地点进行，届时响应供应商的法定代表或其授权代表务必出席调研会，并携带身份证原件以备查核。要求其代表在整个调研会议程中完整履行签到、确认调研结果等职责。 十一、请按医院附件认真准备调研资料，并提供报价单中的样品到现场（检验试剂等冷链储存耗材除外），资料不合格者会失去调研资格。 备注：调研会准备上述纸质资料一式五份及**分钟PPT课件。 十二、联系电话：****-*******（范老师） ****-*******（梁老师） 十三、联系地址：中山大学附属第五医院分子影像中心旁*A号后勤楼***办公室（珠海市香洲区梅华东路**号） 附件*报价单.docx附件*公司质量承诺函.doc                                中山大学附属第五医院                                         ****年*月**日ewebeditor:page title=""/ewebeditor:page下一篇：中山大学附属第五医院体外冲击波疼痛治疗系统维保服务采购项目院内商谈公告[ 返回 ]