基本信息与申购明细项目名称：转录组测序服务项目编号：fjmu********采购单位：福建医科大学预算金额：******.**付款方式按月结算，次月支付上个月所执行的全部检测费。经采购人验收结果后，中标人提交正式发票，三十个工作日内付款。物品名称：转录组测序服务数量：***单位：例预算单价：***.**是否标配：否生产厂家：/型号规格：/申购时间：****-**-**保修期(月)：*送货地址：福建医科大学指定地点设备清单列表：技术参数：一、投标人须知[if !supportLists]*、[endif]请投标方认真阅读“网上竞价人须知”和“网上竞价使用手册”：http://***.******.***/index/download.html*、请投标方将响应文件及相关证明材料（含附件）盖印签字后扫描上传。将所有扫描的图片粘贴至同一份WORD或PDF文档中，请勿逐个图片上传。[if !supportLists]*、报价说明：参照闽财购[****]**号文件规定，供应商提交报价必须低于公告最高限价*％（不含）以上，否则，视为无效报价。在符合采购需求且报价有效的前提下，投标报价最低值中标（报价相同的，以报价时间优先者中标）。*、福建医科******相关问题请咨询****-********。二、技术参数：（一）RNA提取：RNA浓度（ng/ul）≥**，总量（ug）≥*，RIN≥* ；（二）文库构建：摩尔浓度(nM)≥*；文库峰型正态分布，主峰在***-***bp（三）测序：*.测序数据量：*G raw data；*．测序平台及测序策略：Illumina测序平台，测序策略：PE***。*．数据质量：平均Q**≥**%，平均Q**≥**%。*.数据分析流程*.*.组间比较软件：DESeq*（有重复）或edgeR（无重复）；阈值：|log*FC|≥*，FDR＜***.******.***.富集分析数据库：GO/KEGG/DO/Reactome；阈值：FDR＜***.******.***.GSEA分析数据库：GO/KEGG/DO/Reactome 阈值：|NES|*，p*.**，FDR*.***.数据个性分析*.*.组间比较：软件：DESeq*（有重复）或edgeR（无重复）；阈值选择：*)|log*FC|≥*，FDR＜*.**；*)|log*FC|≥*，P＜*.**；*)|log*FC|≥*.*****，FDR＜*.**；*) |log*FC|≥*.*****，P＜*.**；*)其它（根据实际数据合理调整）*.*.富集分析：数据库：包括但不限于GO/KEGG/DO/Reactome，比如MsigDB阈值选择：*)FDR＜*.**；*)P＜*.***)其它（根据实际数据合理调整）***.******.***分析：数据库：包括但不限于GO/KEGG/DO/Reactome，比如MsigDB阈值选择：*)|NES|＞*, p＜*.**, FDR ＜*.**；*)|NES|＞*, FDR＜*.**；*)|NES|＞*, p＜*.**；*)其它（根据实际数据合理调整）*.截止日前，供应商有****篇以上RNA-seq测序的项目文章，其中IF≥*的文章***篇+。*.在线云报告系统和在线云平台工具，提供转录组数据分析的在线云报告系统和在线云工具，可供客户实时交互式分析、使用在线报告进行数据分析、数据筛选、绘图等。*.供应商拥有以高通量测序技术为核心的实验仪器设备，包括高通量自动化样本制备系统、高通量测序仪等检测设备。（四）数据分析*.raw reads质控：fastp*. 序列比对*. 数据质量分析*.样本关系分析*）PCA分析：R语言包(http://***.******.***/)*）相关性热图：R语言包pheatmap*）样本聚类图：R语言包fastcluster*.差异分析*）软件：DESeq*（有重复）或edgeR（无重复）*）阈值选择：|log*FC|≥*，FDR＜*.**；|log*FC|≥*，P＜*.**；|log*FC|≥*.*****，FDR＜*.**；|log*FC|≥*.*****，P＜*.**；其它（根据实际数据合理调整）*）差异基因聚类热图：R语言包pheatmap*）柱状图、盒形图、火山图、散点图、雷达图：R语言包ggplot**.富集分析：自写脚本*）数据库：GO/KEGG/DO/Reactome；*）阈值选择：FDR＜*.**；P＜*.**其它（根据实际数据合理调整）*.GSEA分析*）数据库：GO/KEGG/DO/Reactome*）阈值选择：|NES|＞*, p＜*.**, FDR ＜*.**；|NES|＞*, FDR＜*.**；|NES|＞*, p＜*.**；其它（根据实际数据合理调整）*.互作网络分析：STRING蛋白质互作数据库；cytoscape*. InDel/SNP突变分析：GATK***. RNA编辑分析：GATK***. 基因可变剪切：rMATS**.趋势分析：STEM软件**. 权重共表达网络分析（WGCNA分析）**. 转录因子分析**.ROC分析**. 目标基因分析**.目标基因集分析**.转录组线上操作平台，支持基因分析、功能富集分析、动态交互分析。售后服务要求：[if !supportLists]一、[endif]售后服务要求*．项目周期：送样后**个自然日内发放检测报告。*．中标人提供的检测项目价格不能高于市面上相同产品价格。如采购人收到了相同产品的更低报价，有权不选择中标人提供服务。*．数据存贮周期：不少于*个月。*．具有专门的技术支持团队对接，随时提供检测结果查询服务，*小时内响应相关问题。*．售后服务：成果交付两年内，供应商提供免费的项目咨询服务。如因供应商原因导致项目失败，如服务或产品质量不合格等，供应商承担全部责任并退还已付款。并协商赔偿买方前期所投入的人力财力损失。*.免费向招标方提供上门收取样本并寄送。*.免费向招标方提供项目相关的技术培训服务。*.可以向招标方提供测序数据深度挖掘的科研服务。*.中标人须对所检测项目的结果准确率进行负责，如因检测报告不属实引起的一切纠纷、后果等责任，须由中标人自行承担。采购人不为此承担任何经济和法律责任。**.采购人如对检测结果若有异议，中标人需提供详细原因及支持证据，必要时免费复检。二、签订合同时间：中标人在接到成交通知书后**日内与采购单位签订采购合同。三、供货时间：国产及进口非免税产品为合同生效后**日内，进口免税产品完成办理免税证明后**日内。四、交货详细地点：采购人指定地点。五、报价方式、付款方式及其他要求*、报价方式（*）若投标人所投产品为进口免税产品，投标人应报人民币免税价（CIP，福建医科大学指定地点价。报价中含外贸代理服务费及海关进关等相关费用）。（*）若投标人所投产品为进口非免税产品，投标人应报人民币含税价（福建医科大学校内指定地点价）。交货时应提供相关的海关证明资料。（*）若投标人所投的产品为国产产品，则报产品到达福建医科大学指定地点的人民币价。（*）投标报价含产品、备件、专用工具、安装、调试、检验、技术培训及技术资料和运输保险等费用，采购人将不再另行支付费用。（*）若投标人所投产品为成套产品，应在投标文件《投标分项报价表》中明确列出配套各产品的分项报价（进口产品须注明含税价或免税价）及来源地。*、投标报价需包含货物在采购人单位内的安装、搬运及货物就位的一切费用。*、付款方式（*）国产及进口非免税产品付款方式：货到安装验收合格后**日内付清合同总金额。（*）进口免税产品付款方式：采购合同签订后，学校预支付***%******，******对外付款（货物到达口岸后付**%的合同款，余款**%待全部货物验收合格正常运行三个月后付清）,******提供合法结算单据（外商发票、银行购汇水单、手续费发票等）。*、采购货物如为医疗器械的应符合医疗器械相关管理规定并具备医疗器械注册证。*、若中标产品为进口免税产品，采购人、中标人将共同委托具有******办理货物进口减免税等进口相关手续。*、验收要求：中标人需提供包装完好、全新的货物，所供货物的出厂日期和供货日期之差不得大于*个月。所有货物按厂家产品验收标准(符合国家或行业或地方标准)、招标文件、投标文件等有关部分内容及样品（若有）进行验收，有可能做破坏性实验检查材料是否符合招标文件要求。验收方法：货物安装调试完毕后，进行为期**天的试运行。试运行结束后，采购人对货物性能及技术指标进行评价，符合要求后的，验收通过；不合格的，中标人需进行更换或整改，并重新调试运行直至达到验收合格。验收时中标人应提供招标文件、投标文件及合同等相关材料，如发现货物与之规定不符，采购人有权拒绝接受并向中标人提出索赔。如货物在质量保证期内被证明存在缺陷，包括潜在的缺陷或使用不合适的材料，采购人有权凭有关证明文件向中标人提出索赔。六、违约责任*.质量考核验收标准：供应商在完成合同内容后须向采购人提出验收申请，填写《验收报告》，经采购人同意并安排时间验收合格后，由采购人签字认可。*.违约金：因中标方原因，未能按规定时间完成有关工作的，每延误一天，在中标人书面同意支付延期交货违约金的条件下，采购人有权选择同意延长交货期还是不予延长交货期，采购人同意延长交货期的，延期交货的时间由双方另行确定。延期交货违约金的支付采购人有权从未付的合同货款中扣除。延期交货违约金比率为每迟交*天，按项目预算款的千分之一赔付采购方。逾期交货违约金的支付采购人有权从未付的合同货款中予以扣除。若中标人逾期交货达**天以上（含**天）以上的，采购人有权单方解除本合同，中标人仍应按上述约定支付延期交货违约金。若因此给采购人造成损失的，还应赔偿采购人所受的损失。七、本标书中未明之处，可进行必要的咨询和补充说明。*.中标单位违反采购单位的规章、制度的，一经查实，则视情况暂停或取消其工作资格。*.中标单位若不服从采购单位的安排或未能按时完成采购单位分配的任务，视情节轻重，有权暂停、取消中标单位工作资格，并终止服务合同。*.中标单位提供工作成果不符合实际情况，一经查实，视情节轻重，给予警告、暂停其服务资格，再次出现这种情况，则取消其工作资格，并终止服务合同。*.中标单位利用本项业务之便牟取不正当利益的，一经查实，视情节轻重，采购单位有权暂停、取消中标单位工作资格，并终止服务合同。*.中标单位实验室如出现样本交叉污染、样本掉包或其它影响样本质量及报告准确性的状况应主动书面通知甲方，並交代调查原因及改善方法以避免同样的情况再次发生, 如有隐瞒的情况甲方有权取消中标单位合作资格，终止服务合同及向中标单位追究法律责任。*.投标人承诺在医学检验服务过程中，由于投标方原因造成的医疗差错、医疗纠纷、生产安全、环境保护等事故的相应的赔偿责任由投标方承担。赔偿责任：投标人承诺由于投标方原因造成医疗质量、差错事故、检验报告签发延迟、危急值报告、生产安全、环境安全、信息保密、样本保存等方面的投诉及赔偿责任全部由投标方承担。八、以上条款由采购人全权解释。