广东江门关于遴选江门市病原基因组和宏基因组测序项目服务提供单位的公告
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是否有视频，加载播放器为做好****年江门市病原宏基因及细菌全基因组等测序工作，现向社会广泛征集测序服务提供单位，现将有关事项公告如下： 一、项目内容 对相关样本开展病原宏基因组、细菌全基因组测序及病原一代测序服务。 二、服务机构资质要求 （一）参加单位符合《中华人民共和国政府采购法》第二十二条的规定。 （二）在中华人民共和国境内注册的具有独立承担民事责任的法人或其他组织，并获得工商营业执照。 （三）投标人须具备相关服务的资质或者获得具有相关资质单位的授权，提供相关资质证明和授权文件。 三、提交材料 （一）提供在中华人民共和国境内注册的法人或其他组织的营业执照或事业单位法人证书或社会团体法人登记证书复印件。 （二）提供测序服务的资质或者获得具有相关资质单位的授权，提供相关资质证明和授权文件。 （三）相关项目与*家以上相关单位有合作，每家单位提供一份合作协议及检测报告作为证明。 四、项目内容说明 （一）项目目标 为进一步加强我市病原监测、鉴定和分析预警，及时掌握我市病原特征和流行态势，为传染病的发现、识别、疫情预警提供科学依据。 （二）标本接收 *、投标人承担本项目所有样本转运物流工作，提供可查询的物流运输，确保样本运输的时效性、安全性，并要求送检样本符合相关检测对样本质量的要求。 *、服务供应商应制定具体的物流方案，规范标本接收、登记流程，确保标本顺利交接，方便核查。 *、服务供应商须按照标本必需的条件进行运输，收取标本时，应核对标本信息，仔细检查标记、封口、数量等以保证符合检测的要求，确认无误后方可接收标本。妥善运输、处理和保存标本，保证标本质量和安全，防止出现标本丢失、倾泻、破裂等事故。 *、服务供应商须制定相应的保密工作程序，保证标本的相关信息及资料保密工作。 五、样本检测与要求 （一）病原一代测序技术服务 *、采购数量:**份，最高限价**元/样本。 *、技术要求： （*）要求使用一代测序平台，对送检的样本进行sanger法测序。 （*）要求对被检样品进行核酸提取、反转录和巢式PCR扩增，并对扩增产物进行一代测序和结果处理分析。 （*）要求对扩增后的PCR产物纯化后直接测序，若一次测序结果不理想，需技术分析后进行优化测序。 （*）数据分析：要求对测序产生的数据进行基因系统进化和耐药位点分析并提供分析报告。 （*）可接受不定时分批送样，为保证报告周期，从下单开始计算，**小时内完成收样、检测与报告发放。检测原始数据需**小时内报送到投标人。（需提供书面承诺函并加盖公章） （*）相关项目（一代测序分析项目）与不少于*家以上医疗防控单位有合作，每家单位提供一份合作协议作为证明。 （*）检测标本类型为痰、脑脊液、肺泡灌洗液、血液、粪便、或分离后的菌株等，供应商需提供采样说明以及采样要求和运输要求说明。 （*）服务供应商需提供本项目中所提及的完整测序方案及检测过程中的质控方案。 （*）具有优秀的质量保证体系和工作流程，控制高通量测序过程中出现的样本混淆情况。结账时只支付检测成功的样本费用。 （二）细菌全基因组测序服务 *、采购数量:**份，最高限价***元/株。 *、技术要求： （*）要求对送检的样本进行核酸提取，并进行菌种鉴定，对符合要求的样本进行二代测序。 （*）要求使用Illumina高通量测序平台进行测序，测序读长为*X***bp及以上；测序的原始数据量（碱基数）≥*G；碱基数据质量值Q**比例≥**%；Q**有效数据量（Clean data）≥*G。 （*）要求对新测序的基因组进行初步序列组装和编码基因预测，并进行基本病原特征分析，如毒力基因，耐药基因及MLST分型等。（投标人需提供书面承诺书） （*）可接受不定时分批送样，为保证报告周期，从下单开始计算，**天内完成收样、检测与个性化分析报告、原始数据和拼接数据的发放。（投标人需提供书面承诺书） （*）能提供*次售后分析机会，能提供个性化作图，能提供对应的技术指导。 （*）为保证检测质量和售后服务，检测机构具有针对病原宏基因组或致病菌高通量检测项目检测技术的能力，提供证明资料。 （*）投标人承担本项目所有样本转运物流工作，提供可查询的物流运输，确保样本运输的时效性、安全性，并要求送检样本符合相关检测对样本质量的要求。 （*）相关项目（细菌二代高通量检测）与*家以上相关单位的科室有合作，每家单位提供一份合作协议及检测报告作为证明。 （*）服务供应商配备专门的服务团队，对发放后的报告进行解读，并安排分析人员上门为期两周的个性化分析结果及方法进行培训，使用者若有需求，可以*小时内到达，处理客户相关的数据问题。 （三）宏基因组测序分析服务 *、采购数量:**份,最高限价***元/样本。 *、技术要求： （*）提取：有针对各类样本对应的DNA提取试剂盒/CTAB法/SDS法，进行基因组DNA抽提后，有处理特殊标本的能力，利用Thermo NanoDrop One检测DNA的纯度和浓度。 （*）建库：按照Illumina标准流程进行建库操作。 （*）测序：使用 Illumina Nova ****平台对构建的扩增子文库进行PE***测序，保证每个样本的下机测序数据量≥**G。（投标人需提供书面承诺书） （*）分析：对原始数据过滤拼接，通过MetaPhlAn*及HUMAnN*注释及功能注释，同时可以对特定的序列进行定量分析。有云平台分析系统，包括OUT聚类物种注释，物种群落分析，alpha多样性分析，beta多样性分析，物种差异分析，环境因子关联分析，菌群功能分析，菌群和环境暴露网络分析，中介效应分析。 （*）能提供*次售后分析机会，能提供个性化作图，能提供对应的技术指导。 （*）可接受不定时分批送样，为保证报告周期，从下单开始计算，**天内完成收样、检测与个性化分析报告、原始数据的发放。（投标人需提供书面承诺书） （*）为保证检测质量和售后服务，检测机构具有针对病原宏基因组或致病菌高通量检测项目检测技术的能力，提供证明资料。 （*）投标人承担本项目所有样本转运物流工作，提供可查询的物流运输，确保样本运输的时效性、安全性，并要求送检样本符合相关检测对样本质量的要求。 （*）相关项目（细菌二代高通量检测）与*家以上相关单位的科室有合作，每家单位提供一份合作协议及检测报告作为证明。 （**）服务供应商配备专门的服务团队，对发放后的报告进行解读，并安排分析人员上门为期两周的个性化分析结果及方法进行培训，使用者若有需求，可以*小时内到达，处理客户相关的数据问题。 （四）项目实施要求 *、项目期间对采购方提供的样本完成宏基因测序**份，细菌全基因测序**份，病原一代测序**份。上述三个项目检测份数可根据采购方实际工作需要调整，价格按实际成交价折算，直至完成合同总价服务终止。 *、必须对相关数据信息保密，不得向除采购人外的任何单位与个人透露，否则取消其中标资格；如造成经济损失及不良影响的，追究其经济赔偿责任和法律责任。 *、服务供应商配备专门的服务团队，对发放后的报告进行解读。 *、样本管理：服务方保证对采购方委托标本仅进行委托项目检测，不作其他任何用途（如赠予他人或开展科学研究等），并保证在检测完成后将委托标本按生物安全有关要求全部销毁。 *、结果报告： （*）服务供应商须满足采购人对报告的特殊要求，将检验报告及检验结果汇总表及时发送到指定地点。 （*）服务供应商有完善的检验报告出现异常情况的处理流程。 （*）服务供应商保证所出具的检验报告具有法律效力。 *、监督管理： （*）服务供应商应建立相应的管理制度、管理架构，制定符合本项目要求的各项管理服务质量指标。 （*）服务供应商必须保存好每批标本检测实验原始记录，包括样品编号、结果数据、检测日期、检测方法、质量控制、试剂生产厂家/批号/有效期、环境温度/湿度、操作者/复核者等，并接受采购人的各项监督和检查，包括不定期上门监督管理，对采购人提出的合理意见必须及时做出有效响应。 （五）经费说明 本项目设置最高总价为人民币柒万捌仟元整（*****元）。 五、申请材料报送截止时间和方式 （一）申请材料报送截止日期：****年**月**日。 （二）报送方式：按照本公告第三条要求提交报名材料，一式五份寄送到江门市蓬江区星河路**号江门市疾控中心。公示期限为*个工作日，接受社会各界有意向的服务单位报名。时间截止后不再受理其他报名。 六、联系方式 联系人：梁先生，联系电话：****-*******； 地址：江门市蓬江区星河路**号。 江门市卫生健康局 ****年**月*日附件下载：
