湖北武汉武汉大学蛋白质组学数据分析软件单一来源方式采购征求意见公示
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武汉大学采购与招投标管理中心受高等研究院委托，拟采购蛋白质组学分析软件，使用单位申请单一来源方式采购，现予以公示。一、采购内容：Matrix science 公司Mascot Server蛋白质搜库鉴定软件及Proteome Software公司Scaffold蛋白质组实验数据整合分析工具。*.* 技术要求：基于质谱数据，进行蛋白质搜库、鉴定、定量分析。支持多种质谱系统数据，提供数据分析结果导出及共享在线查看。对蛋白质鉴定、定量、后修饰分析结果进行比较、统计、评估并提供可视化操作。可以进行iTRAQ，TMT和非标记样本定量分析，SILAC、二甲基化定量结果分析，蛋白质翻译后修饰结果分析以及多种来源、大规模蛋白质组数据分析。*.* 主要性能指标：（*） Mascot Server针对质谱数据，利用蛋白质序列数据库比对检索的方法来鉴定样本中蛋白质定性、定量以及翻译后修饰的行业标准软件。（*） Mascot Server是目前大多数 质谱仪器进行蛋白质鉴定标准软件。它支持并能够嵌入的质谱系统包括来自于： AB Sciex、Agilent、Bruker、Jeol、Shimadzu、Thermo Scientific、Waters的蛋白质谱仪。（*） Mascot Server架设在基于HTTP的网络服务中，可以支持从本地或网上提交任意数量的谱图进行搜库鉴定和定量。（*） Mascot Server提供了一个自动化、标准化的数据库上传管理、数据结果解读、导出方案。帮助您不但可以构建面向各质谱仪的数据分析平台，同时可以向整个学校的用户提供在线的分析结果查看和报告输出服务。（*） Scaffold系列软件是进行蛋白质鉴定、定量、后修饰分析结果的比较、统计、置信度评估和可视化浏览的最佳工具。（*） Scaffold支持支持Mascot PEAKS SEQUEST Spectrum Mill IdentityE Proteome Discoverer Phenyx OMSSA X! Tandem Maxquant MS-Amanda等绝大多数搜库软件的定性、定量结果，进行复杂的MS/MS实验定量结果统计分析及可视化。（*） Scaffold Q+S可进行iTRAQ、TMT、 SILAC及二甲基化定量分析，可以自由重组来自多次实验的不同标记信息，进行多个状态间的定量聚类分析。（*） Scaffold PTM可进行蛋白质翻译后修饰位点确证及可视化分析，分析任何类型PTM 信息，比较不同修饰的肽段定量信息，内置motif 分析模块，通过脚本自由输出各类分析结果信息。（*） Scaffold perSPECtives用于追踪成百上千个蛋白质组学实验结果中数以千计的蛋白鉴定结果变化趋势，可以轻松组织或重组海量样本，比较不同样本中同一个蛋白质的修饰差异、序列覆盖度差异。二、 拟采购货物或服务的说明蛋白质组学数据分析在蛋白质组学研究中非常重要的意义，Mascot Server和Scaffold系列软件可以帮助研究者准确地进行蛋白质鉴定、定量、数据结果整合、统计分析，得到更严谨准确的分析结果。三、 采用单一来源采购方式的原因及相关说明目前蛋白质质谱实验已经成为蛋白质组学研究的主要技术手段，面对大批量的质谱数据，如何进行有效的数据分析成为研究成果的关键因素。英国Matrix science公司的Mascot Server蛋白质搜库鉴定软件，是国际认可的进行蛋白质搜库、鉴定、定量分析的行业标准。目前国内进行蛋白质组学研究的实验室基本都在使用Mascot server软件进行质谱数据分析，例如北京蛋白质组研究中心、中科院微生物所、复旦大学等学术研究单位。美国Proteome Software公司的Scaffold系列软件是进行蛋白质鉴定、定量、翻译后修饰分析结果整合、统计、评估和可视化浏览的最佳工具，是蛋白质组学实验室必备的分析软件。目前国内蛋白质组研究前沿的单位如：中国医学科学院协和基础所、中科院辰山植物园、暨南大学等学术单位都是Scaffold系列软件的用户。根据我们的实验要求，只有Matrix science 公司Mascot Server蛋白质搜库鉴定软件及Proteome Software公司Scaffold蛋白质组实验数据整合分析工具能满足。上******为Matrix science 和Proteome Software公司在中国的独家代理商。四、 拟定唯一供应商名称、地址：供应商：上******地 址：上海市松江区沪松公路****弄**号****室五、 公示期：****年**月**日至****年**月**日**时如有其他潜在供应商对本项目采用单一来源方式采购有异议，应在公示期内以书面形式以实名（盖单位公章、包括联系人、地址、联系电话）将意见反馈至武汉大学采购与招投标管理中心。项目经办人：吴老师 肖老师 电话：***-********，******** 传真：***-********技术负责人：王坤 ***********地址：湖北省武汉市武昌区八一路***号邮编：****** 武汉大学采购与招投标管理中心
