广东华南师范大学 -竞价单详情 (JJ19041700000582)
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基本信息竞价主题：环境样本的扩增子测序分析...供应商：北京诺禾致源科技股份有限公...联系电话：已隐藏竞价总价：*****.**竞价编号：JJ**************竞价单报价人：马泽峰联系手机：已隐藏送货日期： 签订合同后*天送货。备注无产品信息详情序号产品名称产品类别标配单位数量应标品牌应标型号产 地偏离说明*环境样品的扩增子测序其他服务否个***.**IlluminaHiseq P...环境样本的扩增子测序分析技术服...无无产品规格：无应标规格：*、测序策略：IlluminaHiseq PE***策略
*、测序数据量：**W reads，该承诺测序数据量为平均测序数据量，每个样本的测序数据量不少于承诺平均数据量的**%
*、文库构建与测序：
（*）PCR扩增：以 DNA 为模板，用带 Barcode 的特异引物进行PCR，确保扩增效率和准确性。（*）PCR产物的混样和纯化：根据PCR产物浓度进行等量混样，然后充分混匀后使用*%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物，对目的条带使用qiagen公司提供的胶回收试剂盒回收产物。（*）文库构建和上机测序：使用TruSeq? DNA PCR-Free Sample Preparation Kit建库试剂盒进行构建PCRfree文库，构建好的文库经过Qubit和Q-PCR定量，文库合格后，使用HiSeq**** PE***进行上机测序。
*、测序数据处理
对原始数据进行去除接头和低质量reads的处理，根据Barcode和引物序列将数据拆分为不同样品，根据Pair end的关系将reads拼接，Tags过滤及嵌合体去除，
*、分析：
（*）OTU分析及物种注释：对OTU聚类及物种注释概况进行统计，包括进行注释结果统计，特定物种分类树分析以及物种注释结果KRONA展示等。并对物种分布情况进行展示，包括物种相对丰度展示、物种丰度聚类热图、三元相图（Ternaryplot）分析、属水平进化树分析
（*）对样品复杂度进行分析：包括Alpha Diversity指数分析、物种多样性曲线（稀释曲线分析、Rank Abundance曲线）、物种累积箱形图、基于OTUs的Venn图/花瓣图、α多样性指数组间差异分析
（*）多样品比较分析：Beta Diversity指数分析、PCoA分析、PCA分析、NMDS分析、UPGMA聚类、组间群落结构差异显著性检验（Anosim、MRPP、Adonis、Amova）、组间差异物种分析（T-test组间物种差异分析、Metastat分析、LEfSe分析）
（*）环境因子关联分析：Spearman相关性分析、Mantel test分析、CCA/RDA/dbRDA分析（需提供环境因子列表，环境因子不能有缺失，且个数不能大于样本个数）、VPA 分析（VPA分析需要将环境因子分为两组）、Network分析【组内生物学重复≥*，按组出图；组内生物学重复售后服务：服务周期*年，技术人员现场解决售后问题。
